Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PNMA2Q9UL42 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNMA2Q9UL42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PNMA2Q9UL42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms