Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DSEQ9UL01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DSEQ9UL01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSEQ9UL01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSEQ9UL01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms