Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCTPQ9UKL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCTPQ9UKL6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCTPQ9UKL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms