Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJD2Q9UKL4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD2Q9UKL4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJD2Q9UKL4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD2Q9UKL4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD2Q9UKL4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms