Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2IRD1Q9UHL9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms