Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCDC2Q9UHG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCDC2Q9UHG0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCDC2Q9UHG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2Q9UHG0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2Q9UHG0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2Q9UHG0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCDC2Q9UHG0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms