Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ASIC3Q9UHC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ASIC3Q9UHC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC3Q9UHC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms