Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA6Q9UF33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA6Q9UF33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHA6Q9UF33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHA6Q9UF33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms