Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC6Q9UBN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC6Q9UBN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC6Q9UBN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC6Q9UBN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms