Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS18Q9P253 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS18Q9P253 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS18Q9P253 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms