Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRFN1Q9P244 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN1Q9P244 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms