Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP1Q9P0J1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP1Q9P0J1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDP1Q9P0J1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDP1Q9P0J1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms