Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTEL1Q9NZ71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTEL1Q9NZ71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTEL1Q9NZ71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTEL1Q9NZ71 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms