Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKIRAS1Q9NYS0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKIRAS1Q9NYS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms