Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PGPEP1Q9NXJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms