Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NMRK1Q9NWW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NMRK1Q9NWW6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NMRK1Q9NWW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NMRK1Q9NWW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms