Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLE1Q9NVX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLE1Q9NVX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLE1Q9NVX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLE1Q9NVX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLE1Q9NVX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NLE1Q9NVX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLE1Q9NVX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLE1Q9NVX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLE1Q9NVX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms