Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TSHZ2Q9NRE2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TSHZ2Q9NRE2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSHZ2Q9NRE2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TSHZ2Q9NRE2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSHZ2Q9NRE2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms