Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AKIP1Q9NQ31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKIP1Q9NQ31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKIP1Q9NQ31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AKIP1Q9NQ31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms