Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMMDC1Q9NPL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMMDC1Q9NPL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms