Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARS2Q9NP81 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SARS2Q9NP81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SARS2Q9NP81 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SARS2Q9NP81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms