Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRPEL1Q9HAV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRPEL1Q9HAV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRPEL1Q9HAV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRPEL1Q9HAV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRPEL1Q9HAV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms