Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NLRP1Q9C000 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NLRP1Q9C000 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP1Q9C000 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NLRP1Q9C000 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NLRP1Q9C000 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NLRP1Q9C000 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms