Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CELF4Q9BZC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF4Q9BZC1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF4Q9BZC1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CELF4Q9BZC1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms