Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms