Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHID1Q9BWS9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHID1Q9BWS9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHID1Q9BWS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHID1Q9BWS9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms