Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC94Q9BW85 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC94Q9BW85 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC94Q9BW85 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms