Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSEN34Q9BSV6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSEN34Q9BSV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSEN34Q9BSV6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TSEN34Q9BSV6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms