Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM2D3Q9BRN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TM2D3Q9BRN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TM2D3Q9BRN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms