Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SELENOSQ9BQE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SELENOSQ9BQE4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELENOSQ9BQE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SELENOSQ9BQE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms