Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VRK1Q99986 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VRK1Q99986 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VRK1Q99986 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VRK1Q99986 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VRK1Q99986 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms