Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LITAFQ99732 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LITAFQ99732 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LITAFQ99732 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms