Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGREF1Q99674 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGREF1Q99674 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGREF1Q99674 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms