Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMB7Q99436 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMB7Q99436 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMB7Q99436 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms