Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PIGSQ96S52 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIGSQ96S52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIGSQ96S52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PIGSQ96S52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PIGSQ96S52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms