Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC85AQ96PX6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC85AQ96PX6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC85AQ96PX6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms