Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIPOR3Q96MK2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPOR3Q96MK2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPOR3Q96MK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPOR3Q96MK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPOR3Q96MK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 497.2 ms