Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC35E1Q96K37 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC35E1Q96K37 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC35E1Q96K37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC35E1Q96K37 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC35E1Q96K37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC35E1Q96K37 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC35E1Q96K37 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms