Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NEURL4Q96JN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEURL4Q96JN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
NEURL4Q96JN8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEURL4Q96JN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEURL4Q96JN8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms