Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF18Q96CE8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF18Q96CE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF18Q96CE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms