Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPTQ96BT3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPTQ96BT3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms