Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP3Q969Y2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP3Q969Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP3Q969Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP3Q969Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP3Q969Y2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTPBP3Q969Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms