Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC10Q969S8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC10Q969S8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC10Q969S8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC10Q969S8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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