Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD1Q969G9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKD1Q969G9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms