Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSR2Q969E8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TSR2Q969E8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSR2Q969E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TSR2Q969E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms