Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATA6Q92908 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATA6Q92908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATA6Q92908 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATA6Q92908 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.4 ms