Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNE4Q8WWG9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNE4Q8WWG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNE4Q8WWG9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNE4Q8WWG9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms