Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRSK1Q8TDC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRSK1Q8TDC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRSK1Q8TDC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms