Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC8Q8TC99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC8Q8TC99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms