Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPRC5AQ8NFJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GPRC5AQ8NFJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPRC5AQ8NFJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPRC5AQ8NFJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms